三国志战略版船只制作核心是先解锁船坞或水寨，再消耗资源建造与升级舰船，基础船自动获取，高级船需逐级解锁并投入材料，战斗损毁后需重建。
船只制作的首要前提是解锁核心建筑，不同剧本对应不同设施。赤壁之战剧本需建造船坞，解锁后自动获得基础舰船走舸，无需额外建造；襄樊之战剧本则需主城达到八本后建造水寨，作为船只改装与管理的中枢。船坞或水寨的等级决定可建造舰船类型与特性解锁程度，满级后可解锁全部高级特性并提升武将水军适性至A级。
舰船分为基础与高级两类，制作规则差异明显。基础船走舸解锁建筑后即有，无建造消耗，仅提供基础水上移动能力。高级船包括蒙冲、斗舰、楼船，需消耗木材、铁矿等资源在船坞中建造，且随船坞等级逐步解锁：1级船坞可建蒙冲，2级解锁斗舰，3级解锁楼船。每类高级船均有基础、中级、高级特性，随船坞升级依次解锁，特性直接影响水上战斗与行军效果。
各类高级舰船的制作优先级与特性适配不同战术需求。蒙冲侧重高速突袭，基础特性提升水上行军速度，高级特性可触发额外伤害，适合爆发阵容；斗舰偏向持久战，具备减伤与规避效果，平局可恢复伤兵；楼船强化攻城与驻守能力，适合战线推进。制作时需结合同盟战略，前期优先建造2-3艘蒙冲用于抢占水域，中后期补充斗舰与楼船完善舰队体系。
船只制作需兼顾资源规划与损耗补充。高级舰船建造消耗大量基础资源，需提前储备木材、铁矿，避免资源短缺延误建造。舰船属于消耗品，部队水上战败后携带舰船会被摧毁，需重新投入资源建造；库存不足时自动降级为走舸出战，因此需保持船坞常备一定数量的高级舰船，避免战时无船可用。同时可通过升级船坞技术降低建造消耗，提升制作效率。
船只制作的进阶玩法在于特性搭配与武将适配。满级船坞可提升所有武将水军适性，非吴国武将也能适配水战，拓展阵容选择。根据舰船特性搭配武将阵容，如蒙冲配高速爆发武将，斗舰配续航型阵容，可最大化水战优势。襄樊之战剧本可通过水寨对船只进行改装，调整行军速度、战斗增益等效果，进一步提升舰队灵活性。
